理事会下设五部三处，即：生产合作部（产业化服务部）、供销合作部（电子商务部）、信用合作部（金融服务部）、项目咨询部（品牌推广部）、管理咨询部（综合服务部）；寿县办事处、凤台办事处、潘集办事处。适时设立名优作物、特色水产、优势畜禽等专业委员会。

一、生产合作部（产业化服务部）

1、为成员提供现代化农业技术交流、推广和托管服务；

2、为成员提供农产品溯源、可视农业等物联网服务；

3、整合农机资源，为成员提供社会化服务。

二、供销合作部（电子商务部）

1、整合农资资源，为成员提供良种、肥料、农药、兽药、饲料等农资供应服务；

2、为成员提供名优农产品销售信息、渠道、市场等服务；

3、为成员提供农场认领、产品定制和田园体验等新型市场化服务。

三、信用合作部（金融服务部）

1、为成员提供信贷融资和担保服务；

2、为成员提供信用互助和保险服务；

3、为成员提供融资租赁和资产服务。

四、项目咨询部（品牌推广部）

1、为成员提供项目申报信息、文本编制、项目申报、评审验收等服务；

2、为成员提供三品一标的申报信息、文本编制、委托检验、托管申报等服务；

3、为成员提供各类龙头企业、示范社、各类荣誉的申报信息、资料、评审等服务。

五、管理咨询部（综合服务部）

1、为成员提供企业管理、制度设计、企业规划、企业文化等咨询服务；

2、为成员提供财务、审计、评估、抵押、法律等咨询服务；

3、为成员提供电商、网站、自媒体等运营服务。

六、寿县办事处

1、负责寿县地区业务发展，为会员提供四三二一综合服务；

2、负责寿县地区的会员发展，引导为农服务中心和名优农产品配送中心的建设；

3、完成农合联安排的其他工作。

七、凤台办事处

1、负责凤台地区业务发展，为会员提供四三二一综合服务；

2、负责凤台地区的会员发展，引导为农服务中心和名优农产品配送中心的建设；

3、完成农合联安排的其他工作。

八、潘集办事处

1、负责潘集及周边地区业务发展，为会员提供四三二一综合服务；

2、负责潘集及周边地区的会员发展，引导为农服务中心和名优农产品配送中心的建设；

3、完成农合联安排的其他工作。